Mit VR Krankheiten wie Krebs bekämpfen

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Forscher der LUND-Universität (Schweden) haben die Technik umgestaltet und die Daten mit Hilfe der 3D-Videospieltechnologie analysiert. Diese Forschung wurde in der Zeitschrift iScience veröffentlicht, wo sie ihre neu entwickelte Software CellexalVR erwähnten.

Die Wissenschaft verfügt über die Technologie, um die Funktion jedes Gens in einer einzelnen isolierten Zelle zu berechnen, und ein einziges Experiment kann zu einer enormen Anzahl von Zellen mit Daten führen. Moderne Techniken der DNA- und RNA-Sukzession haben die Möglichkeit eröffnet, Zellen in Geweben auf einfachere Weise getrennt zu untersuchen. Die größte Herausforderung bei diesen neuen Techniken ist jedoch, dass sie zu großen Datenmengen führen.

Shamit Soneji, Forscher an der LUND-Universität, erklärt: “Wenn man zum Beispiel Krebszellen von normalen Zellen unterscheiden will, muss man Tausende von Zellen untersuchen, um ein richtiges Verständnis zu bekommen, was zu enormen Mengen an numerischen Daten führt.

Um diese Daten verständlich zu machen, wird jede Zelle mathematisch im dreidimensionalen Raum positioniert, um eine “Straßenkarte” der Zellen und ihrer Verbindungen untereinander zu erstellen. Dennoch ist es schwierig, diese Karten mit einem normalen Desktop-Computer zu navigieren.

Ein anderer Forscher von der LUND-Universität, Mattias Wallergard, sagt: “Wenn man in der Lage ist, um seine eigenen Daten herumzugehen und sie intuitiv und effizient zu bearbeiten, erhält man ein ganz neues Verständnis. Ich würde sogar so weit gehen zu sagen, dass man in VR anders denkt, dank der Fähigkeit der Technik, den Körper in den Analyseprozess einzubeziehen”.

Das Team der LUND-Universität hat die Software “CellexalVR” entwickelt, die es den Forschern ermöglicht, mit integrierten Werkzeugen alle ihre Daten an einem Ort in einer Virtual-Reality-Umgebung zu untersuchen. Mit dieser Software können Daten wie 3D-Karten von Zellen und andere Informationen über Genaktivitäten angezeigt werden, und die Forscher können sehen, welche Gene aktiv sind oder nicht, wenn Zellen gebildet werden. Mit Hilfe eines virtuellen Realität-Headsets können die Benutzer das gesamte Universum der Zellpopulationen vor sich sehen. Außerdem können sie mit zwei Handreglern Zellen von Interesse für die Analyse auswählen.

Der Forscher Shamit Soneji kam zu dem Schluss, dass “diese Art der Analyse jedem offen steht, auch wenn man nicht mit Computerprogrammierung vertraut ist. Eine virtuelle Welt ist ein sich schnell entwickelnder Forschungsbereich, der ein enormes Potenzial für Wissenschaftler bietet, die auf interaktive und kollaborative Weise auf große Datenmengen zugreifen und diese verarbeiten müssen”.

Die Software kann heruntergeladen werden unter :

https://www.cellexalvr.med.lu.se/

Quellen :

https://www.lunduniversity.lu.se/article/watch-virtual-reality-tool-be-used-fight-against-disease

https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(21)01220-7

Last modified: 10. Januar 2022

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